A Apub Sindicato tem o papel de representar e defender a categoria docente das Instituições Federais de Ensino Superior da Bahia, lutando pela melhoria das condições de trabalho, salário e carreira. É também tarefa histórica a defesa da Universidade pública, gratuita e de qualidade.  E o que torna o sindicato forte para cumprir sua missão é, sem dúvida, sua base. Os professores e professoras, presentes e atuantes, que têm o poder de encampar as lutas e obter as conquistas.